OMT, an Ontology Matching System

Dissertação de mestrado integrado em Informatics EngineeringIn recent years ontologies have become an integral part of storing information in a structured and formal manner and a way of sharing said information. With this rise in usage, it was only a matter of time before different people tried to use ontologies to represent the same knowledge domain. The area of Ontology Matching was created with the purpose of finding correspondences between different ontologies that represented information in the same domain area. This document reports a Master’s work that started with the study of already existing ontology matching techniques and tools in order to gain knowledge on what techniques exist, as well as understand the advantages and disadvantages of each one. Using the knowledge obtained from the study of the bibliography research, a new web-based tool called OMT was created to automatically merge two given ontologies. The OMT tool processes ontologies written in different ontology representation languages, such as the OWL family or any language written according to the RDF web standards. The OMT tool provides the user with basic information about the submitted ontologies and after the matching occurs, provides the user with a simplified version of the results focusing on the number of objects that were matched and merged. The user can also download a Log File, if he so chooses. This Log File contains a detailed description of the matching process and the reasoning behind the decisions the OMT tool made. The OMT tool was tested throughout its development phase against various different potential inputs to assess its accuracy. Lastly, a web application was developed to host the OMT tool in order to facilitate the access and use of the tool for the users.Nos últimos tempos, ontologias têm-se tornado fundamentais quando os objetivos são armazenar informação de forma formal e estruturada bem como a partilha de tal informação. Com o aumento da procura e utilização de ontologias, tornou-se inevitável que indivíduos diferentes criassem ontologias para representar o mesmo domínio de informação. A área de concordância de ontologias foi criada com o intuito de encontrar correspondências entre ontologias que representem informação no mesmo domínio. Este documento reporta o trabalho de uma tese de Mestrado que começou pelo estudo de técnicas e ferramentas já existentes na área de concordância de ontologias com o objetivo de obter conhecimento nestas mesmas e perceber as suas vantagens e desvantagens. A partir do conhecimento obtido a partir deste estudo, uma nova ferramenta web chamada OMT foi criada para automaticamente alinhar duas ontologias. A ferramenta OMT processa ontologias escritas em diferentes linguagens de representação, tal como a familia de linguages OWL ou qualquer linguagem que respeite o padrão RDF. A ferramenta OMT fornece ao utilizador informação básica sobre as ontologias e após o alinhamento ocorrer, fornece ao utilizador uma versão simplificada dos resultados obtidos, focando no numero de objetos que foram alinhados. O utilizador pode também descarregar um ficheiro Log. Este ficheiro contém uma descrição destalhada do processo de alinhamento e a justificação para as diferentes decisões tomadas pelo ferramenta OMT. A ferramenta OMT foi testada durante todo o processo de desenvolvimento com diferentes tipos de ontologia de entrada para avaliar a sua capacidade de alinhamento. Por último, foi também desenvolvida uma aplicação web para hospedar a ferramenta OMT de forma a facilitar o acesso e uso da ferramenta aos utilizadores

Data security mechanisms for IOT platforms

Mestrado em Engenharia de Computadores e TelemáticaAs plataformas IoT (Internet das Coisas) existentes hoje em dia permitem que diversos dispositivos (“coisas”) com uma fraca capacidade de processamento, como sensores, estejam ligados à rede pública que é a Internet. São colhidos e partilhados dados do meio ambiente que nos rodeia permitindonos conhecer melhor o nosso mundo, agir de forma mais informada e garantir a funcionalidade de certos equipamentos. No entanto, atualmente, os dados são armazenados em claro nas plataformas IoT e podem ser acedidos na sua íntegra por terceiros causando diversos problemas de segurança como a falta de privacidade dos donos dos dados que não conseguem ter qualquer controlo sobre os seus dados produzidos. Como tal, é aqui apresentada uma modificação da arquitetura típica de uma plataforma IoT com o objetivo de adicionar a desejada segurança sobre os dados. Foram adicionadas entidades externas confiáveis de forma a que se conseguisse distribuir as chaves, os dados cifrados e a identificação do utilizador. Desta forma nenhuma entidade, por si só, terá o poder de pôr em causa a privacidade dos utilizadores. A entidade de processamento tem o papel de transformar dados criando anonimato. A entidade de certificação tem o papel de certificar código que irá efetuar essa transformação recorrendo a análise humana. A entidade de autorização tem o papel de permitir que o utilizador possa autorizar ou não todo este processo de acesso e obtenção dos seus dados por parte de terceiros.The IoT (Internet of Things) platforms existing today allow multiple devices (“things”) with a low processing capacity, such as sensors, to be connected with the public network that is the Internet. Environmental data from our surrounding is collected and shared allowing us to better understand our world, act in a more informed manner, perform real-time monitoring of humans and ensure the functionality of certain equipment. However, currently, the data is stored in clear text in the IoT platforms and can be fully accessed by third parties causing many security problems as the lack of privacy of the owners of the data that cannot have any control over their production. As such, a modification of the typical IoT platforms architecture is presented here in order to add the desired security to the data. External trusted entities were added so that elements could be distributed such as the keys, the encrypted data and user identification. Thus, no entity alone has the power to undermine the privacy of users. The processing entity has the role of transforming data creating anonymity. The certification entity has the role of certifying the code that will make this transformation using human analysis. The authorization entity has the role of allowing the user to authorize or not all of this process of access and retrieval of their data by third parties

DeepWings©: automatic wing geometric morphometrics classification of honey bee (Apis mellifera) subspecies using deep learning for detecting landmarks

Honey bee classification by wing geometric morphometrics entails the first step of manual annotation of 19 landmarks in the forewing vein junctions. This is a time-consuming and error- prone endeavor, with implications for classification accuracy. Herein, we developed a software called DeepWings © that overcomes this constraint in wing geometric morphometrics classification by automatically detecting the 19 landmarks on digital images of the right forewing. We used a database containing 7634 forewing images, including 1864 analyzed by F. Ruttner in the original delineation of 26 honey bee subspecies, to tune a convolutional neural network as a wing detector, a deep learning U-Net as a landmarks segmenter, and a support vector machine as a subspecies classifier. The implemented MobileNet wing detector was able to achieve a mAP of 0.975 and the landmarks segmenter was able to detect the 19 landmarks with 91.8% accuracy, with an average positional precision of 0.943 resemblance to manually annotated landmarks. The subspecies classifier, in turn, presented an average accuracy of 86.6% for 26 subspecies and 95.8% for a subset of five important subspecies. The final implementation of the system showed good speed performance, requiring only 14 s to process 10 images. DeepWings © is very user-friendly and is the first fully automated software, offered as a free Web service, for honey bee classification from wing geometric morphometrics. DeepWings© can be used for honey bee breeding, conservation, and even scientific purposes as it provides the coordinates of the landmarks in excel format, facilitating the work of research teams using classical identification approaches and alternative analytical tools.Financial support was provided through the program COMPETE 2020—POCI (Programa Operacional para a Competividade e Internacionalização) and by Portuguese funds through FCT (Fundação para a Ciência e a Tecnologia) in the framework of the project BeeHappy (POCI-01- 0145-FEDER-029871). FCT provided financial support by national funds (FCT/MCTES) to CIMO (UIDB/00690/2020).info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Série de rádio: dengue nas áreas de risco

Este memorial tem o objetivo de registrar o caminho de produção da série de rádio ”Saúde nas áreas de risco”, feito como Trabalho de Conclusão de Curso (TCC) no curso de jornalismo do UniCEUB. O presente texto traz registros e considerações a respeito da produção radiofônica sobre a condição atual de moradores das áreas de risco no Distrito Federal, nos lugares dos mais baixos Índices de Desenvolvimento Humano. A apuração traz informações, por mais óbvias que sejam, que cuidar da saúde não é uma ação que se desenvolve a partir dos postos de saúde e hospitais. Assim como, os problemas não começam nessas unidades públicas, mas, por vezes, dentro das casas de moradores e trabalhadores das chamadas áreas de risco do Distrito Federal

A decade of post-graduated university teaching in advanced wound intervention: e-health and databases research - new borders for knowledge development

Evidence-based practice and the database research are fundamental in order to provide high standards of wound care. We aim to evaluate the use of e-health resources, mainly electronic databases in order to identify the major categories of study interest in post-graduate students in this area

The carved lithic artefacts from the littoral of Vila Nova de Gaia: generic characterization, geoarchaeological contextualization, problems and perspectives

O litoral de Vila Nova de Gaia, a sul da cidade do Porto, constitui um trecho geoarqueológico ímpar para o estudo da ocupação quaternária da fachada ocidental da Ibéria. Neste trabalho apresentam-se algumas características tecno-tipológicas das indústrias líticas do litoral de Vila Nova de Gaia e avançam-se hipóteses sobre os respetivos contextos cronoestratigráficos, litoestratigrágicos e geoarqueológicos. De acordo com observações mais ou menos pontuais realizadas durante as últimas três décadas sugere-se que: a) A indústria lítica mais antiga parece associar-se ao nível marinho I (20-30 m a.n.m.a.m.), podendo ter sido posteriormente remobilizada na sequência de processos coluvionares. A presença de bifaces e de machados de mão entre os artefactos identificados remete-a para o Acheulense; b) A ocorrência de bifaces muito boleados em depósitos coluvionares que recobrem o nível marinho II (10-20 m a.n.m.a.m.), sugere que o seu contexto primário terá sido o referido depósito marinho; c) na base do depósito do nível marinho III da Praia da Aguda ocorrem artefactos líticos enquadráveis no Acheulense (presença de bifaces e de machados de mão); d) nas coluviões sobre os níveis marinhos I e II existem artefactos muito eolizados – aparentemente posteriores às formações marinhas e anteriores à génese das coluviões – e artefactos sem qualquer alteração física – possivelmente coevos dos processos de coluvionamento. Aspetos técnicos e tipológicos observados nestes dois conjuntos artefactuais permitem avançar a hipótese de se relacionarem, respetivamente, com o último período glaciar (idade mínima) e com o Holocénico.The coast of Vila Nova de Gaia, south of the city of Porto, constitutes a unique geoarchaeological stretch for the study of the quaternary occupation of the western facade of Iberia. This work presents some techno-typological characteristics of the lithic industries from Vila Nova de Gaia coastline and hypotheses concerning their chronostratigraphic context are presented. According to general observations carried out during the last three decades it is suggested that: a) The earliest lithic industry seems to be associated with marine level I (20-30 a.s.l.); however, it may have been subsequently remobilized by colluvial processes. The presence of handaxes and cleavers among the artefacts connect this assemblage with the Acheulean; b) The presence of rolled handaxes in colluvial deposits overlying marine level II (10-20 m a.s.l.) suggests that their primary context may have been the mentioned marine level; c) At the bottom of the marine level III deposit from Praia da Aguda (< 10 m a.s.l) there are lithics of Acheulean age (presence of handaxes and cleavers); d) In the colluvial deposits overlying marine levels I and II there are lithic artefacts with a very high degree of aeolisation – apparently younger than the marine formations and older than the colluvial processes – and artefacts with no patina – possibly synchronous of the colluvia. Technical and typological features observed in these two sets suggest that the first one may date from the last glacial period (minimum age) and the second one from the Holocene.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Epigastric pain: incarceration or rotation?

Introduction: Acute intrathoracic gastric volvulus occurs when the stomach has a twist mesenteroaxial/organoaxial or chest cavity resulting in a dilatation or rupture of the diaphragmatic hiatus or diaphragmatic hernia. The purpose of this work is to show a interesting case of gastric volvulus in a patient with several comorbidities. Case Report: A 77-year-old female with past history of hiatal hernia and mental disease associated with diabetes and atrial fibrillation. Patient went to the emergency department due to vomiting associated with blood. Analytical parameters (WBC, HGB, PCR, metabolic panel and liver function), showed no significant alterations. Thoracic X-ray revealed an enlarged mediastinum due to herniation of the stomach. A computed tomography (CT) scan confirmed intrathoracic localization of the gastric antrum with twist. Patient’s symptoms were relieved by nasogastric intubation and analgesia. After six months, the patient is still asymptomatic. Conclusion: In general, the treatment of an acute gastric volvulus requires an emergent surgical repair. In patients who are not surgical candidates (with comorbidities or an inability to tolerate anesthesia), endoscopic reduction should be attempted. Chronic gastric volvulus may be treated non-emergently, and surgical treatment is increasingly being performed using a laparoscopic approach. In this case, it is a chronic form that was solved with the placement of the nasogastric tube. A nasogastric decompression is an option in the chronic form of hiatal hernia associated to gastric volvulus in patients with serious comorbidities

Os artefactos líticos talhados do litoral de Vila Nova de Gaia: caracterização genérica, contextualização geoarqueológica, problemas e perspectivas

O litoral de Vila Nova de Gaia, a sul da cidade do Porto, constitui um trecho geoarqueológico ímpar para o estudo da ocupação quaternária da fachada ocidental da Ibéria. Neste trabalho apresentam-se algumas características tecno-tipológicas das indústrias líticas do litoral de Vila Nova de Gaia e avançam-se hipóteses sobre os respetivos contextos cronoestratigráficos, litoestratigrágicos e geoarqueológicos. De acordo com observações mais ou menos pontuais realizadas durante as últimas três décadas sugere-se que:a) A indústria lítica mais antiga parece associar-se ao nível marinho I (20-30 m a.n.m.a.m.), podendo ter sido posteriormente remobilizada na sequência de processos coluvionares. A presença de bifaces e de machados de mão entre os artefactos identificados remete-a para o Acheulense;b) A ocorrência de bifaces muito boleados em depósitos coluvionares que recobrem o nível marinho II (10-20 m a.n.m.a.m.), sugere que o seu contexto primário terá sido o referido depósito marinho;c) na base do depósito do nível marinho III da Praia da Aguda ocorrem artefactos líticos enquadráveis no Acheulense (presença de bifaces e de machados de mão);d) nas coluviões sobre os níveis marinhos I e II existem artefactos muito eolizados aparentemente posteriores às formações marinhas e anteriores à génese das coluviões e artefactos sem qualquer alteração física possivelmente coevos dos processos de coluvionamento. Aspetos técnicos e tipológicos observados nestes dois conjuntos artefactuais permitem avançar a hipótese de se relacionarem, respetivamente, com o último período glaciar (idade mínima) e com o Holocénico.The coast of Vila Nova de Gaia, south of the city of Porto, constitutes a unique geoarchaeological stretch for the study of the quaternary occupation of the western facade of Iberia. This work presents some techno-typological characteristics of the lithic industries from Vila Nova de Gaia coastline and hypotheses concerning their chronostratigraphic context are presented. According to general observations carried out during the last three decades it is suggested that:a) The earliest lithic industry seems to be associated with marine level I (20-30 a.s.l.); however, it may have been subsequently remobilized by colluvial processes. The presence of handaxes and cleavers among the artefacts connect this assemblage with the Acheulean;b) The presence of rolled handaxes in colluvial deposits overlying marine level II (10-20 m a.s.l.) suggests that their primary context may have been the mentioned marine level;c) At the bottom of the marine level III deposit from Praia da Aguda (< 10 m a.s.l) there are lithics of Acheulean age (presence of handaxes and cleavers);d) In the colluvial deposits overlying marine levels I and II there are lithic artefacts with a very high degree of aeolisation apparently younger than the marine formations and older than the colluvial processes and artefacts with no patina possibly synchronous of the colluvia. Technical and typological features observed in these two sets suggest that the first one may date from the last glacial period (minimum age) and the second one from the Holocene

Automatic modeling of an orthotic bracing for nonoperative correction of Pectus Carinatum

Pectus Carinatum is a deformity of the chest wall, characterized by an anterior protrusion of the sternum, often corrected surgically due to cosmetic motivation. This work presents an alternative approach to the current open surgery option, proposing a novel technique based on a personalized orthosis. Two different processes for the orthosis' personalization are presented. One based on a 3D laser scan of the patient chest, followed by the reconstruction of the thoracic wall mesh using a radial basis function, and a second one, based on a computer tomography scan followed by a neighbouring cells algorithm. The axial position where the orthosis is to be located is automatically calculated using a Ray-Triangle intersection method, whose outcome is input to a pseudo Kochenek interpolating spline method to define the orthosis curvature. Results show that no significant differences exist between the patient chest physiognomy and the curvature angle and size of the orthosis, allowing a better cosmetic outcome and less initial discomfort.The authors acknowledge to Foundation for Science and Technology (FCT) - Portugal for the fellowships with the references: SFRH/BD/74276/2010; SFRH/BD/68270/2010; UMINHO/BI/95/2012; and, SFRH/BPD/46851/2008. This work was also supported by FCT R&D project PTDC/SAUBEB/103368/2008

A influência de um campo magnético estático no escoamento sanguíneo com nanopartículas magnéticas

De forma a realizar estudos de escoamentos em microcanais e avaliar a influência das nanopartículas, sob a ação de um campo magnético estático, na espessura da camada de plasma, foram produzidas nanoparticulas de óxido de ferro por síntese solvotérmica, sendo posteriormente colocadas em suspensão num fluido fisiológico constituído por eritrócitos. Verificou-se que as nanopartículas com características magnéticas proporcionam a diminuição da espessura da camada de plasma, um comportamento contrário ao observado com nanopartículas sem características magnéticas.Os autores agradecem à FCT, COMPETE, QREN e União Europeia (FEDER) pelo financiamento através dos seguintes projetos: PTDC/SAU-BEB/105650/2008, PTDC/SAU-BEB/108728/2008, PTDC/EMEMFE/ 099109/2008, PEst-C/EQB/LA0020/2011 e PTDC/SAU-ENB/116929/2010